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animation更新1.1-5,及彻底删除Git文件历史记录的办法

圣诞节上传了animation v1.1-5到CRAN FTP,不过估计管理员都度假去了,要等一阵子才能放出来了。这次更新主要有两个变化:一是增加了命名空间(NAMESPACE),这玩意儿是我以前没太搞明白的东西,现在明白它的优势了(控制哪些对象是对用户可见的);二是把saveLatex()函数大幅度改写了一下,尤其是用“黑魔法”让它能自动应付Sweave,如果它探测到自己是在Sweave环境中,那么会自动根据代码段的标签和前缀生成动画文件并插入LaTeX文档,而且有选项overwrite=TRUE/FALSE控制是否重画动画(可以看作是最初级的“缓存”方法)。从此以后,在Sweave文档中动态生成动画就方便了,如此一来,也算不辜负这个包被收录在ReproducibleResearch的CRAN Task View中。至于怎么在Sweave中生成动画,若有人感兴趣,我也可以下次在统计之都主站上介绍一下,这东西应该对一些人有用。

我一直在找如何在Git中永久删除某些文件(包括它们的历史记录)的办法,这个问题也是花费我时间最多的一个Git问题,所幸最后终于在GitHub的帮助页面“Removing sensitive data”中找到了答案。尽管我并不完全明白工作原理,但好歹这个办法管用了:

## 注意Windows下用双引号
git filter-branch --index-filter 'git rm -r --cached --ignore-unmatch path/to/your/file' HEAD
git push origin master --force
rm -rf .git/refs/original/
git reflog expire --expire=now --all
git gc --prune=now
git gc --aggressive --prune=now

当时从SVN迁到Git的时候犯了个错误:把整个库都迁过来了(我应该只迁一个子目录),但实际上很多文件都是我不想放到这边来的,比如那些二进制图片文件。它们让整个库的体积增大了太多,而版本控制工具的特点就是记录你对文件的所有操作,包括删除,即使在当前版本中删除了,Git也会在历史记录中记下这些文件,以便随时可以恢复回去。对于这些几十兆的大文件我一直“耿耿于怀”,现在GitHub上的库终于轻松了,大小只有1M了。