Keep on Fighting!

我不确定这是不是R和Sweave能达到的最漂亮的境界：

这两天花了点时间，把跟LaTeX、LyX、Sweave有关的一系列中文问题从头到脚翻了个遍，目前为止，明白并解决了如下问题（基于带有MikTeX 2.8的CTeX 2.8.0.125、LyX 1.6.5、R 2.10.1、R包pgfSweave 1.0.3，操作系统Win XP，从头到尾一直用UTF-8编码）：

1. （LaTeX说中文了）LaTeX生成可复制粘贴的中文PDF文档：由于我的惰性，还用着N年前的CTeX，那个老版本CTeX中的MikTeX貌似一直有问题，比如无法更新LaTeX宏包，更不必说那些dvipdfmx之类的程序了，估计人家作者都已经更新了无数个版本我还不知道。在我陈旧的印象中，要用LaTeX生成可复制粘贴的中文只有一种办法，就是用dvipdfmx把dvi转为pdf，而我陈旧的印象又记得dvi文件只能由latex命令生成，并且用latex编译的文档必须用EPS图形，这一直让我觉得很不爽，因为我实在不爱用EPS，比如R的postscript()设备（可生成EPS图形）不支持半透明色，而且图形中要用中文字符的话配置非常麻烦（N年前我请教了Paul Murrell，虽然搞明白了，但心里仍有疙瘩）。我的偏好是用pdflatex命令编译文档，图形也用PDF格式（pdflatex默认支持PDF和PNG图形），用R生成PDF图形也方便、漂亮，所以配合Sweave很容易生成一篇干净利索的PDF文档；但pdflatex命令直接编译生成的中文文档中，中文字符是不能复制粘贴的，因为复制出来就是乱码。所以呢，我陈旧的知识让我的这个“麻烦问题”一直没有得到解决。
   Continue reading »

近来有些奇怪，有几位R core们居然给本小子写邮件，让本小子着实感到吃惊。比如，首先是Brian Ripley，这是R core中的core，前面提到过他在R源代码中的突出贡献，这位真人不露面、网上找不着照片的大佬，前段时间给我发封邮件说，你小子的animation包的启动消息不正规啊，因为我用suppressPackageStartupMessages()无法屏蔽启动消息；我一看，R里面居然还存在这么长名字的函数，顺便学习了message()函数，从此不再用老土的cat()函数了，后来考虑了一下，干脆把启动消息去掉了，library(animation)不会再有任何提示消息。

然后是我发现Duncan Temple Lang这位不靠谱的大叔做着一些我很喜欢的不靠谱的事情，于是乎对Omegahat心向往之，一来二去聊了聊，将来有机会一定要会一会他。

Sweave对注释的处理是要么完全去除，然后R代码会被整理整齐，要么完全保留，但R代码也保留原样，而我一直希望既能保留注释又能整理代码，这才诞生了animation包中tidy.source()函数（在小邱聪明的技巧下），前段时间想想给Friedrich Leisch，也就是Sweave的作者，发封邮件说了这个事情，打探一下是否能多设置一些Sweave选项，比如把parse()和deparse()函数以选项的形式抽象出来，这样就可以实现既整理代码又保留注释的功能了，不过大叔貌似很忙，回了一封邮件就再也没有音信了，后来由于Michael Friendly对Sweave的一些功能请求在R-help上发了邮件，我们一干人等通过Duncan Murdoch间接了解到Friedrich的确很忙，不过好消息是圣诞节过后Sweave可能会有更新，届时用户可以自行设置图形设备，不必局限在PDF和EPS。但整理代码的事情仍然遥遥无期……唉，还得用硬性Hack的方法。

Martin Maechler前面提过，看到我们开R会，说要向The R Journal交报告啊，回头再跟他谈谈明年R会议的事情。

最意想不到的是，Duncan Murdoch刚才居然给我发个邮件问问题，额滴神啊，这位大叔可是Rtools的管理者、若干个包的作者（rgl等）啊。不过大叔问的是Flash的问题，还好我知道那么一点点，算是能解决。趁此机会，干脆回问两个C语言问题，子曾经曰过：问一个够本，问两个赚一个。

有些LaTeX用户可能觉得敲代码太费事了，那么这里推荐一下LyX。LyX是一个所见即所得的编辑器，因为它基于LaTeX，所以排版质量没啥好说的。关键是它可以和Sweave结合起来用，只要到CRAN下载LyX相关配置文件就可以了。

详细使用方法参见R News 2008年第1卷的第一篇文章”Using Sweave with LyX”。